Никогда серьезно не копался в Битриксе — только шаблоны подправлял, да еще какие-то мелочи, на структуру особенно внимания не обращал.
А сейчас у знакомого сайт на Bitrix ломанули, попросил посмотреть.
Пошел разбираться и испытал настоящий культурный шок. Часть контента сайта хранится в базе данных, часть в файлах. Хм, такая каша.